不同的实验室检查可以帮助医生分析肝、胆囊、胆道的疾病。其中最主要的是一组肝功能试验。根据病人情况，医生也可进行某些影像检查，如超声波扫描、计算机体层摄影（CT）和磁共振成像（MRI），也可取一些肝组织进行显微镜检查，即肝活检。
- 实验室及影像学检查
呼吸试验 检测肝脏代谢不同药物的能力。经放射物示踪标记的药物经口服或静脉注入，测定呼吸中的放射性活性量反映对药物的代谢量。
超声波扫描 用声波产生肝、胆囊和肠道的图像，用以探查结构异常尤为见长，如用超声波扫描检查肿瘤则比肝硬化灵敏度高，是胆囊胆道中最低廉、最安全、敏感度最高的检查技术。
用超声波可以迅速查见胆囊结石，超声波可以轻易区别黄疸是由梗阻引起或是由肝细胞损害所致。另一种超声扫描，血管多普勒超声，可显示肝脏内血管中血流，医生可在肝活检穿刺时用其作为引导以免损伤血管。
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肝功能试验 | ||
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肝功能检查用血液样本完成，绝大多数检测均以测定血中酶及其他物质水平的方法以诊断肝疾病，需要凝固血样本。 | ||
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试验 |
检测方法 |
临床意义 |
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碱性磷酸酶 |
碱性磷酸酶可由肝脏、骨、胎盘产生，在上述器官损伤时释放入血，某些正常情况如骨生长期，妊娠时也升高 |
胆道阻塞，肝损伤及某些癌症 |
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丙氨酸转移酶 |
肝细胞产生此酶，肝细胞损伤时该酶释放入血致其水平升高 |
肝细胞损伤（如肝炎） |
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天冬氨酸转移酶 |
肝脏、心脏、肌肉或脑损伤时释放入血 |
肝、心脏、肌肉或脑损伤 |
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胆红素 |
胆汁成分、肝脏产生 |
胆道梗阻，肝损害，红细胞过量破坏 |
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r-谷氨酸转肽酶 |
由肝、胰、肾产生，这些器官损伤时入血 |
器官损伤，药物毒性、酗酒、胰腺疾病 |
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乳酸脱氢酶 |
某些器官损伤时释放入血 |
肝、心脏、肺、脑的损伤或过量红细胞损坏 |
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仅存于肝脏，肝损伤时释放入血 |
胆道梗阻，胆流紊乱 |
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白蛋白 |
由肝脏产生，正常时释放入血，功能之一是增加血液胶体渗透压 |
肝损害 |
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甲胎蛋白 |
由胎肝产生或实验产生 |
严重肝炎、肝癌或实验原因 |
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线粒体抗体 |
针对线粒体、细胞内成分的循环抗体 |
原发性胆汁肝硬化、某些自身免疫性疾病如慢性活动性肝炎 |
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凝血酶原时间 |
血液凝固所需的时间（凝血过程需维生素K和肝脏产生的其他物质 |
肝损害、胆汁缺乏引起的维生素K吸收减少 |
胆道诊断的X线技术
使用造影剂的三种诊断技术在X线摄影中显示胆管轮廓。
放射性同位素成像 将含有放射性示踪剂的药物注入机体，被某个特别的器官摄取，用γ射线照相机检测其放射性活性，而后经计算机成像。应用被肝脏摄取放射性物质的成像技术叫肝扫描。胆道闪烁计数是另一类型的放射性同位素成像，使用的放射性物质经肝脏排泌入胆道，用于检测胆囊的急性炎症。（胆囊炎）
计算机体层摄影（CT）能提供优质的肝图像，特别用于肿瘤的诊断，也能检查弥漫性病变如脂肪肝或者铁过量引起的肝组织密度不正常（血色素沉着症）。但因CT使用X线，而且价格贵，所以不如超声波使用普遍。
磁共振成像（MRI）提供优质图像，可和CT图像相比，但不足之处在于价格比CT更贵，检查时间长，检查者需躺在狭窄的腔道中，常有恐惧感觉。
内镜逆行胰胆管造影 经口插入内镜（一种可弯曲的可视管道），经胃、十二指肠进入胆道，注入造影剂（一种不透X线的物质）进入胆道，而后摄取胆道X线片，这种检查可造成3％～5％的病人发生胰腺炎。
经皮肝穿刺胆道造影 先用细长针穿刺入肝脏，将造影剂注入胆管分支，穿刺过程中可用超声波引导，而后摄胆道X线片，可清晰显示胆道，特别是有肝内梗阻时效果更佳。
术中胆道造影 手术中，将造影剂直接注入胆管分支，X线时可清晰显示胆管系统。
普通X线摄影 一般X线摄影常能显示钙化的胆囊结石。
- 肝 活 检
通过开放式外科手术，更经常的是经皮肤肝穿刺取得肝脏组织供病理检查。肝穿刺可在局麻下进行，超声波或CT扫描可确定病变位置。在大多数医疗中心，肝活检多在门诊进行。
肝活检病人少数可发生并发症，病人在手术后应留院观察3～4小时。并发症主要是肝脏撕裂伤，发生腹腔内积血，胆汁也可漏入腹腔引起腹膜发炎（腹膜炎）。因为出血可迟至15天才发生，因此这个阶段病人应居住在距医院1小时车程的范围内。这些并发症中，大约2％的病人可出现较严重的问题，死亡率为万分之一。肝活检常有轻微右上腹痛，有时扩展至右肩，用止痛剂可缓解。
经静脉肝活检，导管由静脉插入，通过心脏置入肝静脉，导管针经静脉壁刺入肝脏以获得肝组织，此法较经皮肝穿刺活检发生损伤的可能性小，甚至可用于有出血倾向的病人。
